2026-09-17 每日摘要

三种降解决定子,一个受体识别——对CRBN/VHL用腻了的降解药物开发者来说,这个标题本身就够抓人。最有成药感的是识别C端精氨酸的Kelch通道:Kelch结构域(想想KEAP1)一向擅长在狭窄凹槽里容纳小分子极性配体,所以在这里设计一个紧凑的拟肽锚定基团并非天方夜谭。乙酰化N端识别的内部通道则更模糊——依赖接头蛋白,目前还没有任何小分子摸过乙酰化N端降解决定子口袋,这更像是片段筛选的地盘,而不是近期就能做出分子胶的靶点。最大的隐患是MKLN1通过同一个discoidin-Kelch界面进行自我二聚,意味着任何利用该界面的配体都得和内源性、高亲合力的蛋白-蛋白相互作用竞争——选择性和靶点结合都不会轻松。目前只是纯结构生物学,还没有任何化学实体,但这确实是拓展E3连接酶工具箱、摆脱CRBN/VHL两强格局的一个正当候选。

最巧妙的地方在于笼锁化的VHL配体——氧化应激触发的脱笼机制让弹头在到达病变组织前始终以前药形式沉默,这或许能解决困扰全身给药型PROTAC的外周毒性难题。但我想看对照数据:慢性给药下,非病变CNS组织里脱笼泄漏有多少?所谓“激活态DAPK1”的选择性是不是小鼠构象特异性的产物,放到人源蛋白构象上还成立吗?大环肽-小分子杂合体的合成难度不小——固相肽合成、大环化、再与PROTAC偶联,每一步都在吃掉收率,这不是一条可放大的化学系列,更像是概念验证。真正的突破在于利用随年龄上调的胞吞转运途径,而非固定的RMT受体(转铁蛋白、胰岛素受体)——这才是相对于TfR穿梭型降解剂的实质进步,问题是这条通路能否在各个病程阶段而不仅是老龄模型中成药。

最抓人眼球的一点是,H-膦酸二酯作为P(III)的稳定替代品,可在台面上直接操作——不用再为了装一个新骨架连接就得在惰性气氛下小心伺候对湿气敏感的亚磷酰化试剂。骨架修饰一直是寡核苷酸SAR的老大难瓶颈:糖环或碱基谁都能变,可一旦想跳出硫代磷酸酯/磷酸二酯的范围,往往每个类似物都得单独做一套亚磷酰胺合成。预制的二核苷酸积木单元彻底改变了这一点——先把一小库连接类型做出来,之后就能像普通亚磷酰胺单体一样,在标准固相合成循环里自由搭配、插入到序列的任意位置。对于要跑迭代骨架SAR的团队来说,这就是几周的定制单体弯路和几天出一套类似物之间的差别。真正的问题是,偶联效率和非对映选择性控制能否在整套修饰上都站得住脚,而不只是在展示案例里好看。

马来酰亚胺-半胱氨酸偶联的老毛病谁都清楚——逆迈克尔反应让载荷在血液循环中悄悄脱落,DAR也远没有说明书上那么稳定。这个吡啶/硫蒽鎓双功能骨架就是冲着这个问题去的:生成的芳基硫醚是非手性且水解稳定的,不用再担心非对映异构体混合物,也不用担心和血清巯基发生连接子交换。 先偶联胺、再偶联半胱氨酸,在同一个骨架上实现顺序化学选择性——这不是又一个NHS酯化学的变体,而是对正交载荷/标签安装真正有用的工具。 真正让我留意的是,他们没有止步于多肽订书肽的演示,而是构建了DAR可调的HER2 ADC(MRG002类似物),并证明其血清载荷保留率优于传统连接化学——这才是让方法学从学术噱头变成值得试用的证据。硫蒽鎓试剂的放大生产和成本,将决定它能否最终在GMP产线上取代马来酰亚胺。

非抑制性DUB配体说起来容易做起来难——需要一个占据USP7但不碰触催化口袋的结合物,常规的活性抑制筛选在这里完全用不上。真正有意思的是这套珠上邻近驱动的功能筛选平台本身:比起分子,能否推广到其他DUB靶点才是解决这个瓶颈的关键。DUBTAC这些年一直是降解剂化学的冷门镜像——大家都在追PROTAC,几乎没人手里握着能用的DUB招募配体。WJ045能稳定CFTR是个不错的概念验证,和囊性纤维化生物学挂上了钩,但目前只是单一的细胞稳定化读数——还想看看它在USP家族里的选择性,以及这个平台能否真的再筛出一个不相关的DUB配体。

WBP4是没有可成药口袋的剪接体支架蛋白——这不是给激酶硬塞一条降解标签尾巴的老套路,而是证明CRBN真的能通过G-loop接触被引导到一个“不可成药”的表面上。这个结合假说值得我直接搬到自己手头那堆难降解靶点的可行性筛选清单里。 选择性数据才是真正亮点:全蛋白质组层面干净,剪接扰动也降到最低——这恰恰是分子胶最容易翻车的地方(新底物滥交、RBM39式的隐匿剪接副作用)。两者同时做到并不常见。 wTAG可能比这个降解剂本身更有价值。41个氨基酸的便携式降解标签,还没有钩状效应——这比dTAG系统更干净,比起又一个单靶点先导物,我更想把它收进自己的检测工具箱。

这次的看点首先是探针设计本身:在HDCI骨架上同时实现内质网选择性定位和大斯托克斯位移,不是随手拼凑的荧光试剂,而是能在细胞内保持稳定光物理性质的扎实工程。 真正的价值在于方法学上的转变:一个原本用于机制成像的工具直接充当HTS读出,把hCES2A活性变成活细胞乃至活体内可筛选的表型,弥合了生化检测与细胞真实环境之间常见的脱节。 靶点本身并不新颖——hCES2A早已是将伊立替康活化为肠毒性代谢物的脱靶风险酶,这更像是一次“修补副作用”的努力,而非开辟新机制。 A4是HTS筛选出的共价先导化合物,小鼠数据令人鼓舞,但接下来仍需走完共价命中化合物的常规验证:反应性谱分析、在酯酶家族内的选择性评估以及构效关系优化。